Научно-исследовательская деятельность НОУ ВПО «Восточно-Сибирский институт экономики и менеджмента» неразрывно связана со специализацией вуза в области экономики и менеджмента и включает в себя научные исследования в области экономики, финансов и управления бизнесом, отраслевой экономики и менеджмента, маркетинга и коммерции.

Работа отдела заключается не только в организации научно-исследовательской деятельности факультета института, но и в организации и проведении научных, научно-практических и научно-методических мероприятий. Институт принимает участие Международных, Всероссийских, межвузовских научных конференциях и семинарах, фестивалях и конкурсах. При непосредственном участии отдела организуются и проводятся конференции, семинары, конкурсы, проводится работа круглых столов и мастер-классов. Институт тесно сотрудничает с филиалом ФГБОУ ВПО «БГУЭП» в г. Якутске, НОУ СПО «ЯКИТ»

Ведется работа, связанная с научно-практическими разработками в области экономики и менеджмента. Осуществляются совместно с филиалом БГУЭП научно-практические проекты, такие как, например, «Туристическая карта Якутии», производство имиджевых фильмов РС (Я).

Научно-исследовательский отдел курирует публикацию научных трудов профессорско-преподавательского состава и студентов. В рамках научно-технической комиссии (НТК) действует Студенческое научное общество, в состав которого входят студенты очного отделения факультета. Деятельность НТК связана с деятельностью других структурных подразделений института – кафедры факультетов, учебно-методическая комиссия. Студенты-выпускники вуза при научно-методической поддержке отдела могут продолжить свое обучение в аспирантурах и магистратурах различных вузов.